1、選用良種：選用紅肉網紋甜瓜、白雪公主、隨州大白甜瓜等抗(耐)病品種和伊利沙白、紅甘露、新蜜雜7號、巴的、黃旦子、綠珍珠等早熟品種。同時，與非瓜類作物進行5年以上輪作，最好是水旱輪作。
2、土壤調劑：施用酵素菌漚制的堆肥或充分腐熟的有機肥或在土壤中添加0.5%的s-H添加劑(稻殼、蔗渣、蝦殼粉等加尿素、過磷酸鈣、硝酸鉀制成)可減少枯萎病發生。對酸性土壤應施用消石灰，每畝100～150千克把土壤pH調到中性。
3、種子消毒：浸種可用40%福爾馬林150倍液浸種30分鐘，撈出後用清水沖洗幹凈再催芽播種，也可用50%甲基硫菌靈或多菌靈可濕性粉劑浸種30～40分鐘。用種子重量0.2～0.3%的40%拌種雙粉荊或50%多菌靈可濕性粉劑拌種。
4、藥物防治：采用營養缽育苗，移栽時用雙多懸浮劑(西瓜重茬劑)和神奇不朽300～350倍液灌穴，每穴0.5千克，每畝用藥1千克。對直播的在播種和甜瓜5～6片真葉時分別灌雙多懸浮劑600～700倍液，每穴灌對好的藥液0.5千克，每畝兩次用藥1千克。
