1、可以用清水或者鹽水浸泡進行保存。在短時間保存的情況下，可以將金針菇洗凈，放在水中浸泡，適用於保存一到兩天的金針菇。需要較長時間保存的情況下，可以使用保鮮膜包裹金針菇，使其內部真空。
2、將金針菇洗凈放入容器中，倒入清水使其完全浸入水中。此法宜於短期存放，要註意不要使用鐵制容器，以免金針菇變黑。
3、如果金針菇數量較多，可將其晾曬幹後裝入非鐵質容器中，撒一層金針菇再撒一層鹽，這樣保存的時間可以很久。
4、保存食材最好最方便的方式其實還是冰箱冷藏，建議騰出冰箱的位置，把金針菇放進冰箱裡保存是最方便的。
