1、被慈禧太後投到水井中被淹死。
2、慈禧逃亡西安時，慈禧太後終於對珍妃下瞭殺手，當時侍衛和太監們誰也不敢動手，隻有崔玉貴是個二桿子，他扯過一塊薄毯子，蒙在珍妃的頭上，然後就罷珍妃塞進瞭寧壽宮北端的貞順門內一口水井中，當時，慈禧太後為防止有人去救珍妃，她還親自等瞭一炷香的時間，直到井底珍妃的呼救聲徹底消失，她才命崔玉貴搬來一塊石板，蓋在井口。
3、光緒當時就在殺人現場，他活生生地看著自己的愛妃，就這樣被投到水井中被淹死，別說做為一個皇帝，他就是一個普通的男人，也會恨死瞭慈禧太後，同時也會因為自己無法報仇，而自怨自艾，而在心裡產生深深的愧疚。
4、慈禧太後一口氣跑到瞭西安之後，這一路連驚帶嚇的折騰，也讓她囂張的氣焰減去瞭不少，八國聯軍撤出京城後，她和光緒重新回到瞭紫禁城，想著珍妃的屍骨，還在那口冰涼，陰暗的水井中，慈禧太後晚上就連作噩夢，為瞭以示恩寵，同時也是在消減自己的罪孽，她就在第二年的春天，傳下瞭一道旨意，恩準珍妃的傢人可以到皇宮中收屍。
5、當然，慈禧太後對外宣稱，珍妃並非被自己所殺，她是因怕被八國聯軍所侮辱，為保皇族的清白，故此才投井自殺。
6、當時光緒並沒有出現在珍妃井的啟屍現場，估計任何一個男人，也無法面對珍妃從井中被系上來的慘烈一刻。由於井口太小，啟屍人先扒開瞭井口，而珍妃的姐姐瑾妃領著傢人在一旁祭奠。
7、啟屍人下井之後，先撈出瞭一塊臟兮兮生滿瞭青苔的薄毯子，接著，珍妃的腰上系著繩索，被啟屍人從井底系瞭上來，根據啟屍人的回憶，當時的情形真的是太慘瞭。
8、珍妃全身腐爛，一張臉已經無法認出五官，誰會想到，這具屍體就是曾經一笑百媚生的珍妃？珍妃的身上，掛著井底的淤泥，以及怪味刺鼻的苔蘚，在一片哭聲中，她的屍體被裝到棺材中，先草草地葬在瞭阜成門外恩濟莊太監公墓南面的宮女墓地，後來溥儀即位，隆裕皇太後垂簾聽政，瑾妃（時為兼祧皇考瑾貴妃）將珍妃遷葬至光緒崇陵妃園寢。
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