1、嬰幼兒、孕婦以及手術恢復期半年內傷口沒有得到良好地愈合，都不可以應用深海魚油。
2、有異常消化道疾病的患者，也不建議應用，容易導致胃腸道疾病有加重。
3、對魚或者有一些其它的海鮮有過敏的情況，也盡量減少應用，容易引起異常的過敏發生。
4、深海魚油是一種保健品，不能完全替代藥物，主要就是用於有高血壓、高血脂和有心臟病、動脈硬化的人群，可以起到軟化血管的作用。
5、深海魚油是指從深海中魚類動物體中提煉出來的不飽和脂肪成分，分別為EPA和DHA。由於營養調查發現人體健康需要不飽和脂肪酸成分維持，而且社會人群飽和脂肪超標的原因，大量商業機構開發該類補充品。但是沒有任何權威資料臨床證明該品具備治療高血壓等功能，此外受工藝影響，使用尤其謹慎。
6、來源：深海魚油概念為深海魚類體內不飽和脂肪的簡稱。魚油是指富含EPA(二十碳五烯酸）、DHA(二十二碳六烯酸）的魚體內的油脂。普通魚體內含EPA、DHA數量極微，隻有寒冷地區深海裡的魚，如三文魚、沙丁魚等體內EPA、DHA含量極高，而且陸地其他動物體內幾乎不含EPA、DHA。因此選用深海魚來提練EPA及DHA。
