1、有嚴重胃病的患者。納豆激酶中的嘌呤含量比較高，其具有促進胃液分泌的作用，而納豆當中的膳食纖維也會對胃黏膜造成一些機械性的損傷。所以，那些患有消化性潰瘍、急性胃炎以及慢性淺表性胃炎的患者是不宜食用納豆激酶的。
2、有腎臟疾病的患者。納豆中含有的非必需氨基酸比較高一些，而非必需氨基酸對於腎炎、腎功能衰竭以及腎臟透析患者是十分不利的，所以應該盡量不去食用。
3、痛風的患者。痛風這種疾病大多數情況下是因為嘌呤的代謝失常而導致的，而納豆之中含有嘌呤較多，因此痛風的患者在日常生活中最好要盡量少吃納豆。
4、有急性胰腺炎的患者。當急性胰腺炎發作的時候，患者是要嚴禁食用一切可以刺激胃液以及胰液分泌的食物的。而因為納豆可以起到促進胃液分泌的作用，因此也是不適宜食用的。
5、傷口未愈合。納豆激酶抗血液凝結力很強，如果給剛手術後或者傷口未愈合的患者食用的話，是十分容易造成傷口出血的，因此在傷口未愈合的情況下也要禁止食用納豆激酶。
