1、三年前，小行星撞地球，“閃光”包圍瞭福羅裡達州某海灘附近的燈塔，並形成瞭巨大的，彩色泡沫般的保護層。
2、三年以來，這一區域不斷擴大，政府也派遣瞭一隊又一隊探險隊深入禁區“區域X”一探究竟，卻都是有去無回。唯一生還的是女主角莉娜（娜塔莉·波特曼飾）的丈夫凱恩。
3、回歸後的凱恩已身患絕癥，多重器官衰竭，面臨生命危險。身為生物學傢的莉娜決定和其他4位女科學傢一起，進入區域X，揭開丈夫患病的秘密。
4、在區域X中，他們目睹瞭人類、動物、植物在“閃光”作用下基因變異的奇景，成員也因為各種原因相繼死亡。
5、最後，莉娜隻身來到瞭海邊的燈塔，並在其中見到瞭來自外星的能量團。莉娜的基因被能量團瞬間復制，一個外表、動作、思維、記憶完全同步的“復制人莉娜”產生。
