先天性冠狀動脈疾病，主要是冠狀動脈解剖結構異常，也就是從先天發育中出現的解剖結構的異常，中間有走行的異常，在走行異常當中主要是由於左冠狀動脈或右冠狀動脈起源異常，而使得冠狀動脈走行於主動脈和肺動脈之間，當劇烈運動之後主動脈擴張，而壓迫冠狀動脈，可以造成冠狀動脈的受壓，引起缺血、暈厥，甚至猝死，這是最為嚴重的後果。如果在青少年運動當中出現猝死，需要警惕這種疾病的情況，一旦發現應該手術治療。除此之外，其他的冠狀動脈走行異常，比如冠狀動脈、肺動脈瘺，或者是冠狀動脈的壁冠狀動脈也叫心肌橋，通常到成人之後才發現，一般沒有大的危害。
