肛周濕疹的治療，最關鍵的是幫助患者去尋找患肛周濕疹的潛在原因，最關鍵的先要請患者去肛腸外科會一下診，因為很多肛周濕疹的病人是因為有一些肛腸疾病所導致的，比如肛瘺或者痔瘡，慢慢的刺激瞭肛周的皮膚才引起濕疹。如果沒有發現這些病，沒有控制這些病，肛周濕疹很難很好的得到控制，所以這是最重要的。排除這些病或者已經控制好瞭這些病以後，皮膚科再給予積極的治療，才能達到更好的效果。但是還有些人是跟穿著的習慣有關系，要告訴病人要穿比較寬松、比較透氣的內衣，女性還要註意是否有衛生巾過敏的情況。肛周濕疹的用藥，以坐浴的藥和外用的藥為主，嚴重的時候也是可以吃一些止癢的、幫助睡眠的藥物。在坐浴的藥物裡，西醫建議用3%的硼酸溶液，而中藥以茵陳和苦參的洗劑效果是最好的。外用的藥膏，可以用一些中效的皮質類固醇激素。
