甲功三項檢查常見的是檢查總三碘甲腺原氨酸（總T3）、總甲狀腺素（總T4）和促甲狀腺激素（TSH）。也有的甲功三項檢查是檢查遊離三碘甲腺原氨酸（遊離T3）、遊離甲狀腺素（遊離T4）和TSH。甲功三項的檢查主要是檢查甲狀腺功能是否正常，如果甲狀腺功能亢進，T3、T4增高，TSH水平下降。如果甲狀腺功能減退，T3、T4水平下降，TSH水平升高。一般情況下都查總T3、總T4和TSH這三種激素，但在懷孕或者服用避孕藥的婦女，由於甲狀腺結合球蛋白的增高，總T3和總T4也增高，總T3和總T4不能夠準確的反映體內甲狀腺激素的水平，這時候應該測定遊離T3和遊離T4的水平。
