生殖器皰疹的傳染源是生殖器單純皰疹病毒感染者，一般現癥病人的傳染性比較強。但有一些患者癥狀不典型，危險性更大。還有一些人處於亞臨床感染或者無癥狀的狀態，這種人也有可能會排毒，也具有傳染性。傳播途徑主要是由水平傳播和垂直傳播兩種。水平傳播是指性接觸傳播，這種方式包括生殖器性交、口生殖器性交和肛門性交。垂直傳播是指的母嬰傳播,母親和胎兒間的傳播，包括子宮內感染和經產道感染。由於這種病毒在室溫和幹燥條件下很容易滅活，所以經過唾液傳播和污染物間接傳播比較罕見。當性交和身體接觸的時候，帶毒方的病毒可以直接接種於包皮、龜頭、宮頸、外陰、肛門和口咽黏膜表面，也可以通過生殖器和肛門皮膚黏膜摩擦後出現的微小裂隙及損傷處進入對方的皮膚黏膜。
