亞臨床功能減退是甲減和正常人之間過渡的狀態，也就是見於正常和臨床甲減之間最輕的甲狀腺功能減退程度。各種原因的甲狀腺，像手術、自身免疫性損傷，或者是進行甲狀腺功能亢進和醫學的治療，都可以造成亞臨床甲狀腺功能減退。亞臨床甲減需要不需要治療，一定要結合患者的個體情況，由醫生幫助患者共同的商議。如果是亞臨床甲狀腺功能減退，促甲狀腺激素10μIU/L以上，就進行相應的甲狀腺激素補充，需要治療。如果是在妊娠期間出現瞭亞臨床甲狀腺功能減退，就需要進行甲狀腺激素的治療，減少圍產期的並發癥和對後代智力的影響。如果是亞臨床甲狀腺功能減退，出現瞭明顯的血脂異常、動脈粥樣硬化性疾病，可能醫生也會跟患者交代利和弊，同時幫助患者進行合理的治療。因為如果是出現亞臨床的甲狀腺功能減退，叫亞急性甲狀腺炎，在產後甲狀腺炎或者是在進行甲亢治療的時候，出現亞臨床甲減是否需要治療就需要醫生來判斷。這種情況大部分不需要進行治療，因為隨著病程好轉，亞臨床甲減都能恢復，而且即使不治療也不會造成損害。如果僅僅是亞臨床甲減，而且沒有任何的臨床癥狀，也不是妊娠期，絕大部分患者需要定期復查，不需要特別的治療。
