乳腺囊腫切除後可能會復發，因為乳腺囊腫的發生原因不是太清楚，單純乳腺囊腫的發生可能和雌激素水平過高或復舊、退化、有微小缺陷有關。而瀦留性囊腫可能和乳腺導管不通暢，比如炎癥、腫瘤、結構有缺陷、結構紊亂引起的導管不通暢有關系。通過切除乳腺單個囊腫，別的地方可能會長新的囊腫，即使在切除的局部周圍，也可能腺體組織再出現新的囊腫。所以乳腺囊腫在沒有懷疑有惡變的情況下不建議手術切除，因為沒有必要，而且切除後可能復發。手術是有創的，會給病人帶來一定痛苦，會留下疤，患者也不願意看到。所以乳腺囊腫不建議做手術的切除，因為切除後可能要復發。
