卵巢囊腫根據患者的年齡、臨床癥狀、類型和大小，醫生會選擇不同的方法治療，具體如下：第一、臨床上發現有囊腫沒有任何癥狀，而且比較小，醫生會告訴患者觀察，如果囊腫可以自行消失，就不需要治療。第二、體積較小的囊腫，醫生會給予藥物，中藥有桂枝茯苓膠囊可以用。第三、如果卵巢囊腫比較大，而且存在繼續增大，有惡變的可能，或者以後出現卵巢囊腫、卵巢囊腫發生破裂、囊腫扭轉需要及時手術治療。第四、一般患者沒有什麼自覺癥狀，囊腫也比較小，或者其內充滿液體，醫生可讓觀察，看囊腫幾個月內是否有自行消失。同時，醫生建議定期到醫院去做檢查，做B超看是否有改變。第五、藥物治療，沒有手術指征的囊腫，可以采用中西藥保守治療，根據囊腫的性質來決定，如內膜囊腫可服短效口服避孕藥，巧克力囊腫可以吃。如果懷疑為炎性囊腫，可服用抗生素或中藥，活血化瘀來治療。第六、如果囊腫體積比較大，大約5cm以上，觀察3-6個月以後，囊腫還持續存在，而且囊腫長得比較快，囊腫破裂或扭轉等需要急癥手術，醫生會根據情況考慮手術或者是觀察。
