首先需要明確尿道炎是由於各種致病微生物引起來的，因此要清除致病微生物，這樣首先需要明確尿道炎是由哪一種致病微生物引起來的。如果是普通的大腸桿菌，用一般的喹諾酮類的藥物或者是頭孢類的就可以。如果是支原體或者衣原體的感染，可能要用大環內酯類的、四環素類的藥物等。如果是黴菌引起的感染，可能要用抗黴菌的藥物。總而言之，尿道炎治療的第一、是需要清除病原微生物，因此主要是應用抗菌素等抗致病微生物這一類的藥。第二、在清除致病微生物的同時，也可以緩解患者的癥狀，有效的縮短病程。可以用中藥，比如清熱利濕、解毒的中藥等，都可以對尿道炎的恢復有所幫助。
