對於最早80年代，腎結石的手術都是進行開放手術，比如腎盂的切開取石，腎實質切開取石，無缺血的腎臟的實質切開取石，還有輸尿管切開取石。隨著臨床手術技術器械的發展，近幾年主要都是應用微創的技術進行臨床的碎石和取石治療。常見的硬性的輸尿管鏡，也就是很細長的輸尿管鏡，通過人體的尿道進入到人體的輸尿管，一般常用於膀胱的結石，輸尿管中下段的結石治療。還有輸尿管軟鏡，它的優點是能夠轉彎，一些結石造成的輸尿管梗阻、迂曲它能夠通過這些部位，然後進入到輸尿管上段和腎臟。一般常用於輸尿管一公分多的或者腎臟1.5公分的結石的治療。另外一種常見的微創治療方式叫做經皮腎鏡碎石取石術，也就是老百姓常說從側後背的腎臟的位置，穿一個導絲進去，擴張成一個通道，把腎鏡伸進去。通過激光、超聲、彈道不同的碎石的方式，把結石打碎瞭吸出來。這三種方式都是比較主流的結石的治療方式和手術方式。
