扁桃體化膿叫急性化膿性扁桃體炎，往往是扁桃體被化膿性細菌感染而導致的急性炎癥的反應，化膿會表現在扁桃體表面。由於化膿性細菌感染導致的膿性滲出，在表面結成一些點狀或片狀的膿性物，覆蓋在扁桃體表面，扁桃體刮膿對炎癥的緩解和治療起不瞭太多作用。因為即使把膿刮掉以後，扁桃體炎癥本身沒有得到有效的控制，它很快又會再滲出新的膿性物，形成濃塊或膿胎一樣的東西，重新附著在上面，所以急性化膿性扁桃體炎最主要的治療是抗感染治療。根據病情的嚴重程度一般酌情會使用口服的或者是靜脈輸用的一些抗生素，常用的有青黴素類、阿莫西林、頭孢類，如頭孢拉定、頭孢地尼、頭孢丙烯氧或者頭孢克洛等。這兩類藥物要註意有可能會有過敏反應，如果過敏可以選用其他的，比如紅黴素類，常用的阿奇黴素、阿克拉黴素或羅紅黴素，此外還有喹諾酮類，比如左氧氟沙星、甲磺酸左氧氟沙星或者莫西沙星等等；喹諾酮類要註意18歲以下兒童不建議使用，因為它會影響骨骼的發育。除瞭抗生素的治療之外，可以考慮配合一些清熱解毒、消腫利咽的中成藥，可以同時配合局部的霧化吸入，及含漱液的口含治療，來緩解扁桃體化膿性炎癥導致的癥狀。
