1、透明度。紫水晶透明度較高，由於是晶體的原因給人感覺晶瑩剔透細膩光滑，而紫瑪瑙半透明狀，給人一種朦朧醇厚感，表面像塗瞭一層油脂；
2、紋理。瑪瑙典型的特征是表面有顏色不一的條帶結構，隻是紫瑪瑙不及其他瑪瑙那麼明顯，而紫水晶晶體中能夠看到塊狀的色帶，但是需要在科學儀器下方能看的清楚，肉眼觀察不是很明顯，需仔細觀察；
3、顏色。紫水晶的顏色主要有淺紫色、紫紅色、深紫紅、大紅、藍紫等顏色，顏色均比較純正，高貴大氣，大傢都比較喜歡，大致透明度比較高，可明顯看到內部的冰裂紋或白色雲霧雜質；紫瑪瑙顏色淡到深，帶有灰色調，不夠溫潤，透明度較低，無法明顯看到內部包含物；
4、化學成分。紫水晶的主要化學成分為二氧化矽，因含有鐵、錳等礦物質而形成漂亮的紫色；紫螢石的主要化學成分為氟化鈣，因含有氟礦物的比例不同而呈現顏色不一的紫色螢石晶。
5、摩氏硬度。紫水晶的硬度比較高，呈三方晶系，摩氏硬度為7；紫螢石硬度較低，摩氏硬度為4，呈等軸晶系，兩者相化出現劃痕的為子螢石晶。
天然的紫瑪瑙還是比較少見的，市面上出現的大多數都是經過人工染色的，在購買時需要進行鑒別。其實，天然的紫瑪瑙產出非常少，市面上見到的，大多是染色的，因此沒有什麼特別之處。
