1、自動變速器因構造復雜故傳動效率比手動變速器要低，所以費油。
2、自動檔的變速時機是根據傳感器感知的扭矩（負荷及節氣門開度）變化而模擬設置的換檔點；而手動檔的換檔時機則是根據駕駛者的意願（駕駛水平）--隨機及預見性的判斷而把握換檔點的。
3、自動變速箱與手動變速箱不同的是：自動變速箱擁有一個油壓系統，它的作用是供應液壓式變速箱動力油。這個動力油系統一般要分去大約5千瓦的動力傳遞，此外在行駛時也會因扭力轉換器的作用而損失一些能源。但這個裝置要求車輛在運動時盡可能進入一個檔位，讓油泵持續運轉，否則，N檔位運轉狀態的自動變速箱會因油壓不足而燒損。
4、車輛行走是依靠發動機的扭力，通過自動變速箱磨擦片及齒輪傳送到傳動系統，確切地說也就是扭力轉換器的動力傳輸，這套含有油料轉換器的機構就能夠使車輛加速。一般發動機的機械能損耗就是消耗在轉換器初期的液壓系統上，之後又耗損在機械的轉換上。因此大部分自動檔車比手動檔車耗油量大。
目前，部分轎車變速箱已經運用一個檔位鎖定裝置克服扭力轉換器的損耗，不過得等到車速達到某一個特定速度時(例如30km/h，因車而異)，這個功能才會發揮作用，這樣自動檔車和手動檔車耗油量差不多。
