1、土地性質不同。經濟適用房是政府劃撥用地，可以享受很多政府制定的優惠政策，這是經濟適用房的所在，商品房基本上是不可以享受優惠的，因為它的用地都是通過出讓的方式獲得的。
2、產權限制不同。經濟適用房的土地是由政府劃撥的，所以購買者擁有的是不完全產權，即使買瞭房也就隻能拿到產權證，無法拿到土地證。如果想要出讓，隻能在滿足購買時間達到五年，並繳納土地出讓金才可以進行，商品房則沒有這樣的限制。
3、購買對象不同。如果要經濟適用房那麼購買方必須是常住城鎮的中低收入傢庭，並且名下沒有任何房產，而商品房的的購買對象就沒有這樣的限制，基本上隻要已達到年齡的完全民事行為能力人，並且有足夠的錢款就可以買房瞭。
4、房屋面積不同。由於經濟適用房是以保障性為主，並且主要出售給收入較低的傢庭，因此在房屋面積以及結構上都有一定的規定和限制，房屋面積必須達到建設標準，滿足購買方的基本需求。而商品房則是出於對獲益的追求，更加重視如讓房屋建設做到獲益大化，在房屋面積和結構上沒有具體的規定，全由企業自己決定。
5、建設目的不同。商品房的建設目的是為瞭賺取獲益，是由房地產開發企業將土地進行開發，並且建設房屋，進行上市出售的房子，但是經濟適用房卻並非如此。經濟適用房的建設的目的是為瞭給一些經濟困難的傢庭提供保障，是根據國傢建設計劃安排建設的。
6、銷售價格不同。既然是經濟適用房是由國傢相關機構安排建設的，那麼價格自然是由政府制定，又因為房屋的建設目的是為瞭提供保障，所以價格一般要比市面上的房屋價格低一些。而商品房是由開發企業建設的，價格自然是由企業決定，為瞭賺取利益，價格自然要比經濟適用房的價格高很多。
經濟適用房和商品房各有各的優勢，可以從兩者的區別來看出，而且因為房屋性質不一樣，所以優勢肯定也有很多不一樣。
