1、UV殺菌燈可以破壞生物DNA，既可以殺菌，也可以消滅藻類，抑制浮遊藻類、青苔的生長，以防止魚隻生病，凈化水質，改善生態。可以用它來消除水中的小球藻。一般來說三天左右綠水就可以消失。
2、使用凝結劑把浮遊性的藻類凝結過濾掉。但是凝結劑會對龍魚產生傷害，所以不推薦使用。
3、生物控制。使用喜食藻類的水蚤，將小球藻吃掉。但是水蚤通常是魚類的食物，所以隻適合沒有水草缸使用。
4、鹽度控制。小球藻是窄鹽性生物，對鹽度的增加非常敏感，所以在水中加鹽對綠水的消除很有幫助。
5、除藻劑。除藻劑雖然效果明顯，但是會對魚和水草產生傷害，一般不建議使用。
6、抑制生長。陽關是小球菌進行光合作用的前提，所以可以通過減少光照、減少喂食、加強換水的方法抑制小球菌生長，而且比較安全。缺點是時間會比較長。
