1、化學成分不同。黃寶石是一種復雜的矽酸鹽，它的主要化學成份是二氧化矽，再有一定的自然條件下，當二氧化矽結晶完美時就是黃水晶瞭。由於黃寶石的化學成分比較復雜，所以現在還不能通過人工合成得到黃寶石，而合成的黃水晶則遍佈很多市場，所以可見黃寶石和黃水晶的化學成分是不同的。
2、比重。黃晶比重輕，為2.6，而黃寶石則比重大，為3.95，二者之間的比重差別用手即可輕易的分辨出來，黃寶石壓手，黃品感覺輕飄。
3、硬度。二者之間的硬度差別很大，黃寶石為9，而黃晶為7，在擦痕，牛毛紋的表現上可以有明顯差別。
4、光性。黃寶石具有剛玉類寶石的一種光性特點，即寶光勒光之類。在一定的角度下，微微轉動寶石，就可以感覺到這一光性特點的存在，而黃晶隻不過晶瑩而已。
黃寶石是一種復雜的矽酸鹽，黃水晶是一種無色透明的石英結晶體礦物。黃水晶的主要化學成份是二氧化矽，當二氧化矽結晶完美時就是黃水晶瞭。由於黃寶石的化學成分比較復雜，目前還沒有合成的黃寶石的出現，而合成的黃水晶則遍佈很多市場，可見黃寶石和黃水晶的化學成分是不同的。
