1、五歲的宗介與媽媽理莎,在一個靠海小村莊的山崖上。身為船長的爸爸長年出海,留下宗介與媽媽相依為命。因此五歲的宗介從小就超齡的懂事,也知道自己必須擔起傢中的責任,要代替父親照顧媽媽。一天當他在山崖下巖石遍佈的海灘上玩耍,他拾回瞭一隻頭困在玻璃瓶裡的人魚波妞,宗介救出波妞並且將她養在一個綠色的塑膠水桶裡。
2、波妞與宗介相互著迷。宗介跟波妞說:“別擔心,我會保護你、好好照顧你。”,但是波妞的父親魔法師藤本,逼著波妞跟他回海裡。波妞堅決不肯並開始大吵大鬧,她心意已決,要變成人類小女孩回到宗介的身邊,於是波妞竟然決定離傢出走。就在她離傢之前,波妞把爸爸最珍藏的“生命之水”倒到海水裡。這個舉動造成極大的動蕩,海平面開始快速上升,波妞的妹妹們都變成瞭魚形的巨大海浪並吞噬瞭宗介住的小鎮,還差點連宗介山崖上的傢都波及。