1、概念不同。純水機：超細精度的RO膜反滲透的方式，流住水中的一切有機污染物，出水為直飲的純凈水；凈水機：通過過濾和吸附的方式去除氯氣和各種有害的污染。
2、凈水技術不同。純水機：通過有著超細精度的RO膜反滲透的方式截流住水中的一切有機污染物和無機離子，有一定的廢水量，出水為直飲的純凈水；凈水機：通過過濾和吸附的物理方式去除城市自來水中的氯氣和因二次污染所產生的細菌病毒、膠體、鐵銹、雜質等各種對人體有害的有機污染物。
3、使用裝置不同。純水機：有增壓泵、電機、電源、儲水罐，為五級過濾。級為濾芯，第二和第三級為活性炭，第四級為RO逆滲透膜，第五級為精致活性炭，用於改善口感。可加第六級放置麥飯石；凈水機：沒有電機、電源、儲水罐，靠水壓驅動過濾，采用不銹鋼管機身，耐高溫、腐蝕。比較好的為五級過濾，級為濾芯，第二和第三級為活性炭，第四級為中空絲膜或陶瓷過濾，第五級為精致活性炭，主要用於改善口感。
4、使用功能不同.純水機：能過慮掉自來水中所有物質，包括礦物質，出來的水是純水，相當於我們買的純凈水。從某種程度上來說，純水機就是純凈水廠的小型化，以自來水作為水源，通過反滲透水處理技術凈化出純水。傢用純水機精致小巧一般安裝於廚房，並配有一純凈水專用龍頭，除瞭直接飲用喝，還能解決炒菜等用水問題，裝純水機並不影響飲水機的使用，因為純水機自制的純凈水可通過飲水機加熱或制冷。
5、凈水機：能夠過濾掉自來水氯、雜質等，保留自來水中的對人體有用的礦物質。不過，凈水機對重金屬和水堿的過濾作用不是很大，所以不能直接飲用，還是燒開後在飲用。若是傢裡隻有凈水機，可以把第三級活性炭換成樹脂芯，這樣就可以去除水堿瞭，不過用一段時間後就需要把樹脂芯拆下來放在鹽水裡浸泡讓它再生還原。
6、凈化後水質不同。純水機：出來的水相當於外面賣的瓶裝的純凈水，如果加上麥飯石，大致相當於礦泉水；凈水機：保留瞭自來水中大部分的礦物質，是可以生飲的凈化水。
純水機、凈水器之爭，更類似於純凈水、礦泉水之爭。事實上，人體從飲水中所獲得的微量元素隻占極少量，是否含礦物質對飲用水的安全並無太大影響。選購純水機還是凈水器，還是要根據當地水質來判斷。
