1、時間段不同。這是兩個時期最大也是最明顯的區別。侏羅紀是介於三疊紀和白堊紀中間的一個時期，這個時期的持續大約在一億九千萬年前到一億四千萬年前。而白堊紀則是從侏羅紀結束之後一直持續到瞭6600萬年前。
2、兩個時期的動物差別。雖然侏羅紀和白堊紀都有恐龍，而且恐龍是當時地球的主宰者。但是，侏羅紀是恐龍和其他生物繁衍生息最鼎盛的時期。三疊紀是恐龍和其他生物開始的時期，而侏羅紀則是鼎盛時期。這個時期是幾乎所有的恐龍種類共存的一個時期，而且這個時期也是昆蟲的發展期，各種各樣的昆蟲開始繁衍生息。而白堊紀則不同，經過瞭三疊紀和侏羅紀的發展和進化，到瞭白堊紀，許多大型的恐龍和一些蛇類以及小型的哺乳動物開始出現，而且在這個時期被子植物開始繁衍。
3、兩個時期的地質也不同。其實，“紀”的劃分就是根據不同時期的不同地質來決定的。比如泥盆紀就是因為有一層紅色的砂巖沉積才得名的。而侏羅紀和白堊紀也是如此，侏羅紀是有一層灰巖沉積，而白堊紀則是有一層白堊沉積（白堊沉積是指碳酸鈣的沉積物），而白堊沉積是最早的粉筆的原材料。
