灌腸就是把液體灌入肛門以內，當液體在體內，尤其是直腸達到一定的量之後，人就會有排便的感覺，灌入的液體就會跟體內的糞便混合，就可以幫助把體內的糞便排出到體外。臨床上灌腸可以清潔腸道，像在做結腸鏡前準備時，有些人難以耐受口服大量的洗腸液，就可以擴充局部的灌腸。當然，灌腸可能很難清洗到完整的結腸，主要可以把直腸、乙狀結腸，甚至降結腸的部分可以清洗幹凈。便秘的病人也可以考慮往直腸腔內灌生理鹽水或者肥皂水，有助於排出大便。臨床上會選擇比較大的甘油灌腸劑，每一支的劑量大概有110ml，通過肛門打到直腸裡面，讓患者保留一段時間，也可以起到潤滑腸腔、刺激排便的作用。此外，有特殊的疾病，像潰瘍性結腸炎會選擇灌腸劑型的藥物來達到治療疾病的效果。
