腦炎分兩種情況，一種是病毒性腦炎，另一種是自身免疫性腦炎。病毒性腦炎主要指的是各種各樣的病毒，比較典型的像皰疹病毒，還有艾滋病腦炎，以及狂犬病引起的腦炎、特殊病毒引起的腦炎，除瞭皰疹病毒引起的腦炎能夠徹底根治之外，其他幾個腦炎不能被治愈，而且可以逐步導致人體全腦功能衰退和死亡。還有一種腦炎是自身免疫性腦炎，是由於其他疾病激發瞭人體的自身免疫紊亂而導致的腦部炎癥。是沒有病原體的腦炎，主要是一種反應性腦炎，因此治療方法主要用免疫抑制劑和激素控制不正常的免疫反應，這種腦炎有一小部分可以治愈，但大部分不能被治愈。綜上所述，大部分腦炎不能被完全治愈。
