間日瘧的患者在起病初期並不一定表現為高熱，首先通常表現為低熱，伴有乏力、頭疼、全身不適等前驅癥狀。開始發作時也不一定有規律，患者可以表現為發熱不規則，但隨著發作次數的增多，逐漸變成周期性的發作。間日瘧通常隔日發作一次，發作時患者首先表現為畏寒、寒戰、全身打哆嗦。同時，患者可以出現口唇發紺、皮膚蒼白，有頭疼、肌肉痛、乏力、惡心、嘔吐、上腹部不適等癥狀。大約持續十幾分鐘的時間，患者可以出現高熱，體溫一般可以達到39-41℃，患者寒戰停止。在高熱的時期，患者表現為顏面潮紅，有頭疼、口渴，嚴重的患者可以出現譫妄、抽搐，甚至昏迷。發熱大約持續數小時，高溫可以突然消退，表現為大汗。患者出汗後表現為困倦，有想睡覺的感覺，這個時期大約持續2-3個小時，患者的整體發作告一段落，通常隔日再發作一次。在間歇期，患者通常沒有癥狀。
