直腸癌放療副作用有局部性損傷和全身性損傷，局部性損傷有放射性腸炎，主要是在放射中後期出現，患者會感到腹部不適，進食或飲水後加重，嚴重時可出現腸梗阻。第二個局部性損傷是放射性皮炎，在放射初期可見皮膚發紅、發癢，類似日曬性皮炎改變，放射中期皮膚色素沉著，變厚粗糙，毛孔粗黑，放射後期可在皮膚皺褶處出現濕性蛻皮，局部皮膚浮腫，嚴重時出現水泡，繼而破潰糜爛，甚至出現潰瘍。直腸癌放療出現全身不良反應，有消化道反應，放療初期患者常感出現口幹、大便幹燥，在放療中後期患者可發生食欲減退、惡心、嘔吐，以及骨髓抑制。表現為全身乏力，血液學檢查發現白細胞總數下降。
