生殖器皰疹是由單純皰疹病毒感染引起來的，它可以通過水平傳播和垂直傳播的途徑發生傳染。水平傳播是指性接觸傳播，方式有生殖器性交、口生殖器性交和肛門性交。垂直傳播是指母嬰和母親胎兒間的傳播，包括子宮內感染和經產道感染。它的傳染源主要是生殖器單純皰疹病毒感染者。一般現癥病人的傳染性比較強，而癥狀不典型的患者危險性更大。還有一些人屬於亞臨床感染和無癥狀狀態，他也有排毒的時候，也會有傳染性。一般在性交和身體接觸的時候，帶有病毒的一方，他的病毒可集中於包皮、龜頭、宮頸、外陰、肛門和口咽黏膜表面，也可以通過生殖器或肛門皮膚黏膜摩擦後出現的微小裂隙及損傷處進入易感者的皮膚黏膜，所以生殖器皰疹是可以傳染的。
