各種原因造成供應腦幹的椎基底動脈血管的主幹或者分支發生閉塞就會引起腦幹梗死，腦幹包含瞭人體許多重要的神經結構，如傳導感覺、支配運動、維持平衡的各種傳導束，也能維持人體清醒，調節人體呼吸、心跳、睡眠等各個神經中樞、神經核團。當腦幹發生瞭梗死，所造成的後果取決於閉塞血管損傷的時間、損傷的范圍、嚴重程度以及治療是否及時、有效。椎基底動脈主幹的閉塞，如果治療及時，溶栓使血管再通，也有可能會完全恢復。小的分支血管閉塞，如果治療不及時也有可能會進展，腦幹梗死最好的後果是多因素影響的，既有血管本身的因素，病人全身的狀態也有治療的影響。
