甲狀腺疾病可以看內分泌代謝科、核醫學科、普外科或耳鼻喉科等，具體看哪個科室要看患有哪種疾病，甲狀腺疾病是各種病因導致的甲狀腺形態、組織結構、功能發生異常的一大類異質性甲狀腺疾病病譜，包括瞭較多的具體甲狀腺疾病，從病因上包括瞭Graves病、自身免疫性甲狀腺炎、甲狀腺腺瘤、甲狀腺癌、單純性甲狀腺腫、藥物或手術對甲狀腺的損害等。從功能上分為甲狀腺功能亢進癥和甲狀腺功能減退癥，不同的病因和功能狀態需要到不同的科室去就診，比如Graves病使用抗甲狀腺藥物治療或者甲狀腺功能低減使用甲狀腺藥物治療等，需要到內分泌代謝科就診，Graves病用碘-131同位素治療時，需要到核醫學科或內分泌代謝科就診。Graves並手術治療需要到普外科或耳鼻喉科就診，所以甲狀腺疾病要到哪些科室就診需要看具體是哪種甲狀腺疾病。
