重度的甲狀腺功能減退會影響垂體性腺功能，導致很難懷孕。輕度或者亞臨床的甲狀腺功能減退一般不影響懷孕，但是輕度或者亞臨床甲減婦女如果甲狀腺功能沒有糾正到正常，一旦懷孕會影響胎兒的神經系統發育，導致出生後子代的智商有所下降。如果甲減婦女通過甲狀腺替代治療，使甲狀腺功能恢復正常，在這種情況下懷孕，懷孕過程中及時的調整甲狀腺激素的用量，使甲狀腺激素水平在妊娠的正常值之內，這種情況下甲減的婦女同樣可以生出聰明、健康的寶寶。所以重度的甲狀腺功能減退很難懷孕，亞臨床或者輕度的甲狀腺功能減退婦女能夠懷孕，但是有可能影響子代智商。甲減婦女通過甲狀腺激素替代治療使甲功恢復到正常，這種情況下懷孕不影響子代的智商和健康。
