1、研究的范圍有所不同
教育科學研究包括一切教育現象和教育過程以及與此現象有關的各種現象；而教學研究的主要研究內容是教學的內容、過程、方法、手段以及教學管理等微觀領域的問題。
2、科研與教研的直接目的不同
教育科研是一種探索性的活動，是一種創造性活動，是一種對已有規律不斷進行檢驗的活動。科研的目的是為瞭探索教育的客觀規律。教學研究的直接目的是為瞭搞好教學，提高教育質量。其主要途徑是通過開展多種形式的教研活動（如說課、集體備課、集體研討、教材培訓、優質課評比等）。另外，教研工作有學科教學管理的任務。
3、研究的過程不同
教育科研的過程是一個探索的過程，強調創造與開拓。在學術研究的領域裡，不能有任何的主觀限制，科學的結論是不能通過行政決定而確立的。而教學研究主要是為日常教學服務的。盡管也強調創造與開拓，但這種創造與開拓必須限定在一定的規定范圍之內。如學科教學大綱，各級行政部門制定的法規性文件等。學科教研工作必須以更有效地貫徹教學大綱為前提，以上級教育主管部門下發的管理性文件為依據（如教學常規、教學管理辦法等），不能任意自行其事。
3、成果及其成果的表現形式不同
教育科研的成果是新的科學知識，表現形式為科研論文、研究報告、操作方案等；教學研究成果則是教學質量的提高、學生學業上的進步、教學管理上的規范等。盡管這兩方面的研究經常是同時獲得成果的，然而它們並不能相互替代，既不能認為寫出瞭研究報告就等同於教學成效，也不能用教學效果替代科學成果。有的人認為教育科研的成果就是學科成績的提高，比如用平均分、及格率的提高幅度，用幾個學生考上重點大學等等作為科研成果的量化指標是十分片面的。
