1、陰涼通風處。剝開的菠蘿蜜，菠蘿包包上保鮮膜，然後放在紙盒或是竹筐中，內襯蕉葉或竹葉，也可以用碎紙，然後存放在陰涼通風處，存放溫度註意保持在11-13度左右的樣子，濕度85～95%條件下，這種可以保存5到7天左右。當然，在5天內吃完是最好的，溫度太高的話，5天後容易發酵。
2、保鮮膜冷藏。將剝開的菠蘿蜜的菠蘿包裹上保鮮膜，放在冰箱冷藏室裡，這種可以保存五天左右。但一般建議放冰箱冷藏兩三天足以，不然影響口感。
3、加工成菠蘿蜜幹。吃不完的菠蘿蜜還可以直接通過加工做成果幹，用烤箱或者微波爐，小火慢烤，中途翻面，逐漸烘幹水分即可，這樣加工出的菠蘿蜜幹，可以放很久的。
冷藏但不要冷凍。菠蘿蜜不宜放在冷凍室久凍，這樣口感和營養都會大打折扣，放冰箱的話，放在冷藏室就可以瞭。存放時間不要長。
