1、生長環境不同。
基圍蝦是廣溫廣鹽性蝦類，廣泛棲息於沙底、沙泥底、泥底的海區，在沿海50米等深淺范圍內均有分佈，而以10米內數量較多，也就是海蝦。
鳳尾蝦用的是河蝦，廣泛分佈於我國江河、湖泊、水庫和池塘中的河蝦（又稱青蝦，學名叫日本沼蝦（Macrobranchium nipponense）），是優質的淡水蝦類。
2、指代范圍不同。
基圍蝦指的是一類蝦的品種，用做指代，有好幾個種類。
而鳳尾蝦是一道是南京的傳統菜肴，金陵菜（京蘇大菜）的代表之一，與松鼠魚、蛋燒賣、美人肝並稱為“京蘇菜四大名菜”。
3、種類不同。
基圍蝦指的是刀額新對蝦，包括有泥蝦、麻蝦、花虎蝦、虎蝦、砂蝦、紅爪蝦、盧蝦，商業上稱基圍蝦。鳳尾蝦指的就是在河裡生長的那種。
