1、精英裡程不同。南航明珠金卡累計標準裡程的30%，南航明珠銀卡累計標準裡程的15%。
2、本人經濟艙全票價訂座時間不同。南航明珠金卡持卡人可以在航班起飛前48小時提出保證本人經濟艙全票價訂座，南航明珠銀卡持卡人可以在航班起飛前72小時提出保證本人經濟艙全票價訂座。
3、南航貴賓休息室特權不同。南航明珠金卡持卡人可以邀請一名當天同是乘坐南航航班的旅客共同進入明珠精英會員休息室，南航明珠銀卡持卡人僅限本人進入明珠精英會員休息室。
4、行李免費標準不同。南航明珠金卡持卡人每超額20公斤行李計作1件，南航明珠銀卡持卡人每超額10公斤行李計作1件。
5、在航班不正常的時候，南航明珠金卡和銀卡持卡人可以在餐食、住宿、賠償方面，享受優於經濟艙旅客的服務優待，具體標準按照南航不正常航班旅客規則執行。
6、南航明珠金卡和銀卡持卡人可以在廣州、北京、上海（浦東）、大連、哈爾濱、長春、沈陽、烏魯木齊、武漢等地的南航機場，使用相關權益。
