1、金針菇不能和寒性食物一起吃。金針菇從食物屬性來看屬於寒性的食物，含有較多的寒氣，而生活中金針菇除瞭煮湯食用外，還常用來做涼菜食用，因此，寒性較重，不宜和其他的寒性的食物一起吃，以免引起脾胃虛寒，出現消化不良。常見的寒性食物有：鴨肉、苦瓜、冬瓜、綠豆、黃瓜等。
2、金針菇不宜和高粗纖維食物一起吃。金針菇含有大量的粗纖維，而食用有時整根食用的，胃腸很難完全消化掉，若是同時在和其他的高粗纖維食物一起食用，容易導致消化不良，出現便秘癥狀。常見的高粗纖維食物：芹菜、韭菜、竹筍、蒜苗等。
3、金針菇不宜和高鈣食物一起吃。鈣的吸收需要維生素D的參與，而維生素D在人體中是有限的，往往補鈣人群都需要額外補充維生素D，而金針菇中含有較多的磷，磷的吸收也需要維生素D的參與，會間接的抑制鈣質的吸收，降低補鈣作用。常見的高鈣食物有：動物骨頭、蝦蟹等軟甲食物、牛奶等。
4、金針菇不宜和蛤蜊一起吃。金針菇中含有較多的維生素B1，B族維生素是人體必須的一類營養素，並且在很多食物中都不含有，而蛤蜊中含有維生素B1的分解酶，和金針菇一起食用會直接分解維生素B1，降低食物營養價值。
