1、結構不同，翡翠和瑪瑙的主要區別在於結構不同，翡翠是硬玉的一種，內部是以纖維交織的結構為主，經過燈光照射可以看出明顯的礦物晶粒，而瑪瑙屬於軟玉的一種，屬於隱晶質礦物的集合體，內部看不出礦物的晶粒。
2、顏色不同，通常翡翠的原色主要以綠色居多，其品質也是最好的，表面顏色為片狀或者絲狀，仔細觀看還有一些明顯的色根，而瑪瑙的顏色是以紅色為上品，顏色的層次紋理分佈均勻，沒有明顯的色根或者色帶。
3、密度不同，同時翡翠和瑪瑙的密度也是不同的，通常來說瑪瑙的密度是在2.6～2.7克每立方米，表面主要呈為蠟質光澤，而翡翠的密度是在3.25～3.4克每立方米，將同塊大小進行稱量的話，翡翠要比瑪瑙重很多。
