1、營養價值不同：乳酸菌飲料的蛋白質含量一般在0.7-1.0%之間，而酸奶的蛋白質含量要遠高於此。而且喝乳酸菌飲料隻能獲取較多的乳酸菌，喝酸奶則可以獲取較多的乳蛋白和乳鈣，較低的乳糖和一定數量的乳酸菌。
2、性質不同：乳酸菌飲料是含乳飲料的一種，是以乳或乳制品為原料，經乳酸菌發酵制得的乳液中加入水、白砂糖和甜味劑、酸味劑、果汁、茶等配料調制而成的飲料。而酸奶則是以牛奶為原料，經過巴氏殺菌後再向牛奶中添加有益菌，發酵後再冷卻灌裝的一種牛奶制品。
3、口感不同：由於乳酸菌飲料在制作的時候加瞭水、果汁、茶等多種配料，所以口味上會比較清淡，有多種不同的口感，但奶味不濃。而酸奶口感醇厚綿軟，質地比較粘稠，喝起來有著濃鬱的奶味，酸甜爽口。
從上面的介紹中可以知道，酸奶和乳酸菌飲料的區別主要體現在營養價值上、性質上以及口感上，而且從這三個方面來比較的話，可以清楚的看出酸奶和乳酸菌飲料的區別。
