1、都有好處。鮮奶、純牛奶都含有大量的蛋白質、脂肪、礦物質、乳糖等成分，兩者都有較高的營養價值，適量食用都能為人體補充多種所需的營養物質，鮮奶和純牛奶主要是殺菌方式不同，建議根據個人所需選擇。
2、殺菌方式不同。鮮牛奶：鮮牛奶是采用巴氏殺菌處理，也就是低溫消毒法，這種方法既可以殺死病菌，又能保持牛奶含有的營養物質及風味不變，也叫巴氏殺菌乳。純牛奶：純牛奶是采用超高溫滅菌，高溫滅菌時的溫度極高，瞬間溫度可達到130℃，雖然溫度非常高，但對牛奶所含營養成分的破壞較小。
3、保質期不同。鮮牛奶：鮮牛奶中仍然有部分耐高溫的菌類存活，因此保質期較短，一般在冰箱冷藏的情況下，可以保存5~7天。純牛奶：超高溫滅菌使牛奶中含有的菌類全都被消滅，因此保質期較長，在常溫下，可以保存1~3個月。
