1、抗菌作用，它具有廣譜抗菌作用、是消炎殺菌、軟化血管的首選藥物。尤其對痢疾桿菌、肺炎雙球菌、葡萄球菌有抑制作用，對關節炎有較好的抑制作用。
2、抗癌作用：木瓜中的SOD(SOD為超氧化物歧化酶的英文縮寫)活力極高，具有抗衰老、抗癌、調節免疫力和防輻射的作用。
3、護肝作用：它能有效地降低轉氨酶，促進肝細胞再生，防止肝硬化，是當今最有效的治療肝病的藥物之一。同時還具有強心、利尿、降血脂、提高免疫力的功能。
4、抗疫殺蟲。番木瓜堿和木瓜蛋白酶具有抗結核桿菌及寄生蟲如絳蟲、蛔蟲、鞭蟲、阿米巴原蟲等作用，故可用於殺蟲抗癆。
