1、4-6攝氏度下冷藏：龍眼比較適合在4-6攝氏度的環境下冷藏保存,像動物冬眠一樣,在這個溫度下,龍眼有生命可以呼吸,卻消耗很少的能量。但是並不能放在密封塑料袋中保存,而要用網狀的保鮮袋來保存,以利於它的呼吸長久。新鮮桂圓果皮較軟，也不可堆太多層，2-3層是比較好的堆放層數，保存至冰箱前最好將果皮風幹，然後裝在保溫盒中，或者用保鮮膜、保鮮袋封存，再放到冰箱裡。
2、紙盒保存：新鮮的桂圓可以直接風幹表皮後，放在能透氣的紙盒中，然後儲藏在通風、陰涼並且比較幹燥的地方，如果桂圓太多，可以用紙板加強承壓度，將桂圓分層隔開放置，避免桂圓底層壓壞，流出汁水提前變質，這樣還會導致大面積的損壞，如果空間較多，可以將桂圓直接平鋪放置，也能避免桂圓的相互擠壓。
3、速凍保存：在1小時內把龍眼果實的溫度降到-30℃,並長期貯於-18℃環境中。果實能保持原來外觀和固有風味,營養成分損失少。食用時先用冷水解凍,馬上食用。
4、曬幹保存：如果購買的龍眼比較多也可以選擇把新鮮的桂圓拿去曬幹，保存起來。曬幹的桂圓保存的時間比較長，而且也會別有一番風味。曬幹的桂圓應放在箱子裡，用塑料蓋起來，然後放在陰涼處，要經常查看下預防發黴、蟲蛀等。
