脂肪肝最主要的並不是靠藥物治療，主要是針對病因和降低危險因素。脂肪肝的原因，可以是飲酒所引起，所以如果是酒精性脂肪肝，戒酒肯定是第一位。如果是代謝綜合征所引起的，控制血糖、降低血脂可能有助於脂肪肝的改善。控制危險因素主要是要改變生活方式，建議低糖、低脂的平衡膳食，肥胖的患者應該每日減少熱量的攝入，並且進行中等量的有氧運動，體重明顯的下降，當然不建議迅速的下降，也能改善肝臟炎癥、壞死的程度，但過度的減肥有可能還會加重肝臟的損傷。當脂肪肝發展為脂肪性肝炎，也就是肝細胞受損瞭，這時才建議用藥物，用保肝藥物，如多烯磷脂酰膽堿，水飛薊賓等，所有藥物都是經過肝臟代謝，所以脂肪肝用藥一定要慎重，因為過度的用藥反而過猶不及，甚至會帶來副作用。
