兒童手足口病初期的癥狀有輕有重。輕度的話一般癥狀就是說它有一個潛伏期，潛伏期的話有3-5天。然後孩子出現有低燒，全身的不舒服，可以有腹痛。另外，口腔黏膜可出現有疼痛性的，有粟粒大小至綠豆大小的水皰，手和腳可以出現皰疹。皰疹呈橢圓形，這大小3-7mm，像米粒的大小。叫水痘的皮疹是比較小的，水痘大傢都知道它是一個水皰的。而這種手足口的話，它是皮疹的話直接比較硬，周圍有紅暈，皰內的液體比較少。除瞭手足口之外的話，也可以在肛門附近，在臀部周圍偶爾有。有一部分孩子可以在軀幹或者四肢可以出現皰疹。數天後幹枯、消退，皮疹沒有燒熱，也沒有疼痛感。個別孩子會出現泛發性的丘疹，出現小水皰，伴發無菌性的腦膜炎、腦炎、心肌炎。可以有咳嗽、流鼻涕、食欲不振、惡心、嘔吐、頭痛這些癥狀。還有一部分孩子僅表現為皮疹，或者是皰疹性的咽頰炎，他整個病程大概是5-10天，多數可以治愈的。預後是比較好的，一般是不會有後遺癥的。
