萬古黴素的替代藥品一般考慮選擇替考拉寧或利奈唑胺，以上兩種藥物一般會結合感染部位、感染細菌種類，是敏感菌，還是耐藥菌等進行選擇，主要分析如下：1、肺部感染：一般會首選利奈唑胺，因為利奈唑胺肺泡組織濃度較高，治療肺部感染效果較好。2、中樞神經系統感染：一般也會首選利奈唑胺，因為利奈唑胺能夠透過血-腦屏障，而替考拉寧透過血-腦屏障濃度非常低，故一般不選擇替考拉寧治療中樞神經系統感染。3、腹腔感染：兩者都可以選擇，既可以應用利奈唑胺，也可以應用替考拉寧，替考拉寧對於腹部感染治療效果較好。4、耐藥菌感染：比如耐萬古黴素的屎腸球菌，需要首選利奈唑胺。因為替考拉寧對耐萬古黴素的腸球菌治療效果不好，再就是替考拉寧本身起效較慢，若萬古黴素和利奈唑胺能夠選擇，通常不首選替考拉寧。
