試管嬰兒總體是比較安全的技術，但仍然會有卵巢過度刺激綜合征、多胎妊娠和取卵當中並發癥的可能性。試管嬰兒經過30多年發展，已成為比較安全的治療不孕癥主要手段之一，總體比較安全，並發癥比較少，但仍然會有一定並發癥可能性，比如卵巢過度刺激綜合征，就是由於體內多個卵泡發育所導致的一系列癥狀，可能會有胸水、腹水、靜脈或動脈血栓、呼吸窘迫綜合征可能性，嚴重者可能會危及生命。多胎妊娠可能會有流產、早產、妊娠期高血壓疾病、糖尿病、產後出血等並發癥，取卵過程中可能會有出血、感染、膀胱等臟器損傷並發癥可能性。因此，試管嬰兒需要嚴格把握指征。
