潰瘍性結腸炎的治療目的是控制急性發作、使黏膜愈合、維持緩解癥狀、減少復發和防治並發癥，可以見於以下幾方面：第一、控制炎癥反應，根據病情的輕重可以分別選用5-氨基水楊酸、糖皮質激素和免疫抑制劑。對於輕度潰瘍性結腸炎，建議患者應用5-氨基水楊酸。對於對5-氨基水楊酸效果不佳，以及中重度的患者，建議應用糖皮質激素。糖皮質激素隻能用於誘導緩解，不能長期服用。長期服用建議應用免疫抑制劑，比如硫唑嘌呤等。第二、對癥支持治療，及時糾正水電解質平衡紊亂，貧血者可以輸血，低蛋白血癥者應補充白蛋白。病情嚴重者應禁食，並給予完全的胃腸外營養治療。對於腹痛、腹瀉的患者，對癥治療要權衡利弊，使用抗膽堿能藥物或止瀉藥物，比如地芬諾酯或者洛哌丁胺使用時要慎重，對於重癥患者應禁用，因有誘發中毒性巨結腸的危險。
