黑痣通常無需治療，如果治療，首選手術切除。手術切除後精細的美容縫合有利於傷口的愈合，減少瘢痕形成。術後瘢痕纖細不明顯，後期配合藥物及激光治療，瘢痕更細小。手術切除能夠保證足夠的范圍和深度，確保痣細胞切除幹凈，切下的標本可以送病理檢查，以防誤診、漏診。激光或冷凍治療比較容易形成瘢痕，且常常治療不徹底，可能會導致黑痣的復發，如果反復對復發性痣進行激光或冷凍治療，不良的刺激會大大增加黑痣惡變的幾率，但如果小於兩毫米的黑痣，尤其是比較表淺的交界痣，也是可以選用激光的方法，小的黑痣相對來說容易清除幹凈，而且瘢痕也不太明顯。
