1、含義不同：基金按照對象劃分為股票型基金，債券基金，社保基金，混合基金等，而機構是指除個人投資者以外的機構，因此不止包含瞭基金，還有保險，券商，信托等。
2、持股比例不同：如股票基金持倉投資比例不得低於80%用於投資者股票，混合偏股型基金投資股票要在50%-70%之間，社保基金入市比例不得超過30%等。但是機構持倉就沒有限制。
3、投資目的和期限不同：基金是為瞭中長線的價值，所以部分上市公司大股東名單中可以看到基金持股，它不會隨時變化或退出，因此買賣股票也受到限制。但是機構投資者的目的是為瞭短期的利益，一般通過拉高股價，再出貨獲得收益。
4、信息披露不同：基金每日公佈凈值，會公佈月報，季報，半年報，年報等。但是機構不會發佈自己盈利虧損情況。
雖然說機構持股的比例沒有限制，但是一般他們會有一個投資方案，不會把所有的資金壓在某個股票上，而是會分散投資，這樣持股比例就降下來瞭，基金也是差不多的。
