1、醫用外科口罩應用於有體液、血液飛濺的環境裡，這類型的口罩可以有效隔絕血液和體液，防止血液、體液穿過口罩感染佩戴者，但是對顆粒的過濾則有所不足。醫用防護口罩應用於有呼吸道傳染病環境裡，可過濾空氣中的微粒，阻隔飛沫、血液、體液、分泌物等污染物，對非油性顆粒的過濾效率可達到95%以上。
2、醫用防護口罩必須同時具有外科口罩的主要功能，包括細菌過濾效率和阻隔具有壓力的液體噴濺物的功能，同時還具有呼吸防護功能，即保護佩戴者的呼吸安全。而且醫用防護口罩的顆粒過濾效率性能要高於醫用外科口罩。
3、醫用外科口罩因為具有良好的防水性能以及顆粒過濾效率，適用於手術、激光治療、隔離及牙科或其他醫療操作時的佩戴，以及空氣或飛沫傳播疾病或者佩戴；主要滿足醫院手術操作人員使用。
4、醫用防護口罩因為具有良好的顆粒過濾效率，能有效過濾病毒，所以適用於醫務人員接觸空氣傳播和飛沫傳播疾病患者時的職業防護或者接觸具有傳染性的微生物時使用。
